Red Alert 3-s rändab hukule määratud Nõukogude Liidu meeleheitel juhtkond ajas tagasi, et muuta ajalugu ja taastada emakese Venemaa au. Ajas rändamise missioon läheb viltu, luues alternatiivse ajaskaala, kus tehnoloogia on järginud täiesti teistsugust arengut, maailmaareenile on tõrjutud uus superriik ja möllab Kolmas maailmasõda. Tõusva Päikese impeerium on tõusnud idas, muutes III maailmasõja kolmepoolseks võitluseks nõukogude, liitlaste ja impeeriumi vahel armeedega, kes kasutavad veidraid ja imelisi relvi ja tehnoloogiaid, nagu Tesla mähised, tugevalt relvastatud sõjavihmad, teleportatsioon. , soomustatud karud, intelligentsed delfiinid, ujuvad saarekindlused ja ümberkujunevad tankid. Red Alert 3 esitab küsimuse "Mis siis, kui?" Mis siis, kui viimase 70 aasta iga veider uurimisprojekt ja tehnoloogiaeksperiment oleks vilja kandnud? Mis siis, kui Philadelphia eksperiment, ajas rändamise teooria, teleportatsioon, nähtamatus, Tesla tehnoloogia ja sada muud intrigeerivat uurimisprojekti oleksid end ära tasunud ja läinud peavoolu? Mis siis, kui Nõukogude Liit püsiks ja õitseks; kuidas see 10 aasta pärast välja näeks? Mis siis, kui Jaapani impeerium poleks kunagi langenud ja sellest oleks saanud ülim kõrgtehnoloogiline sõjaline suurriik? Lõpptulemuseks on kujutlusvõimeline ja mänguline nägemus alternatiivsest tulevikust, mis on täis võimalusi.
