Alphadia Genesis stāsta par episko piedzīvojumu kopā ar Freju un viņa izmeklēšanas komandu no Arkleinas karalistes, kad viņi tuvējā pilsētā cenšas atrisināt noslēpumainu slepkavības lietu. Pēc dažām sākotnējām izmeklēšanām Frejam un viņa pavadoņiem pievienojas delegāti no Ghalzabine Karalistes.
