Final Fantasy II ļaundabīgais imperators izbeidz mūžīgo miera periodu. Viņš ir aicinājis monstrus no dēmoniskas valstības pārņemt pasauli. Viņu uzbrukumiem padodas tūkstošiem dzīvību, daudzi bērni paliek bāreņi. No iznīcināšanas paceļas četri jauni izdzīvojušie, kuri uzņemsies to, lai apturētu nežēlīgo valdnieku un atriebtos par savu vecāku nāvi.