Stāsts sākas tur, kur beidzās Killzone 2, ar Visari, nežēlīgo helghastu diktatoru, kurš guļ miris pie Speciālo spēku karavīru Seva un Riko kājām. Cīņa varbūt ir uzvarēta, bet karš vēl nebūt nav beidzies. Visari nāve ir atstājusi aiz sevis politisku shēmu, iekšējo cīņu un klaju slepkavību pasauli. Tikmēr viņa atvadu dāvana, kodolbumba, kas detonēta Fīrusā, Helghanas galvaspilsētā, ir iznīcinājusi ISA iebrukuma spēkus. Tā kā nav pastiprinājumu un krājumi ātri izsīkst, tagad tev vienam pašam jācīnās pret nežēlīgo helghastu kara mašīnu.
Ar desmit reizes lielākiem līmeņiem nekā Killzone 2, šī ir Helgana, kādu tu nekad iepriekš neesi redzējis. Tu saskarsies ar brutālu cīņu virknē vides, kas draud tevi aprakt uz nāvējošās planētas. Killzone 3 ļaus jums šķērsot toksiskas kodoltuksneses, apmaldīties nāvējošos citplanētiešu džungļos, cīnīties skarbos arktiskos apstākļos un doties kosmosā, cīnoties pret helghastu kundzību — katrai vietai ir atšķirīgs spēles stils, kas jums jāapgūst.
Killzone 3 būs pilnībā spēlējama stereoskopiskā 3D režīmā, kas jūs vēl dziļāk iegremdēs mežonīgajā pasaulē un novietos jūs darbības centrā. Taču esiet uzmanīgi. Piedzīvojot šo pasauli neticamā, augstas izšķirtspējas, stereoskopiskā 3D detaļā, jūs iemācīsities baidīties no tā, kas atrodas aiz katra stūra.