Super Meat Boy Forever notiek dažus gadus pēc Super Meat Boy notikumiem. Meat Boy un Bandage Girl jau vairākus gadus dzīvo laimīgu dzīvi bez Dr. Fetus, un tagad viņiem ir brīnišķīgs mazulis vārdā Nugget. Nugget ir prieka personība, un viņa ir viss Meat Boy un Bandage Girl. Kādu dienu, kamēr mūsu varoņi bija piknikā, doktors Fetuss pie viņiem pieķērās, ar lāpstu zaudēja samaņu Meat Boy un Bandage Girl un nolaupīja Nugget! Kad mūsu varoņi ieradās un atklāja, ka Nugget ir pazudis, viņi zināja, kam doties. Viņi salauza savus pirkstus un nolēma nekad neapstāties, kamēr nav atguvuši Nugetu un iemācījuši doktoram Fetusam ļoti svarīgu mācību. Mācība, ko var iemācīt tikai ar sitieniem un spērieniem.
