Cotton Fantasy mängib sarnaselt sarja varasemate mängudega, selle süsteemid on enamasti üle võetud Cotton Reboot!-st. Lisaks traditsioonilistele külgkerimise etappidele on mängul ka Panorama Cottoni ja Rainbow Cottoniga sarnased rööbaste tagavaatetasemed. Rebooti Jewel Feveri mehaanik on ümber töödeldud ja nüüd langevad esemed vaenlaste käest, kui neid tabab maagiline loits.
