Lugu toimub kahe päikesega planetoidil, kus neli liiki elasid täiuslikus harmoonias… Kuni päevani, mil dr Funfrock, geniaalne teadlane, leiutas kloonimise ja teleportatsiooni, võttes järk-järgult elanikud oma täieliku kontrolli alla.
Twinsenina mängides oled eeskujulik kodanik, kellest saab üleöö dr Funfrocki käsilaste jälitatav põgenik. Oma teekonnal saarelt saarele pead väsimatult otsima teisi mässulisi ja moodustama maa-aluse võrgustiku, et lõpetada kloonide okupatsioon.
Relvastatud oma salapärase võlukeraga, mis muutub seikluse edenedes üha võimsamaks, oled ainult sina võimeline kukutama võimud, mis…