Super Meat Boy Forever leiab aset paar aastat pärast Super Meat Boy sündmusi. Meat Boy ja Bandage Girl on mitu aastat elanud õnnelikku elu ilma doktor Fetust ja neil on nüüd imeline väike beebi nimega Nugget. Nugget on rõõm kehastatud ja ta on Meat Boy ja Bandage Girli jaoks kõike. Ühel päeval, kui meie kangelased olid piknikul, hiilis dr Fetus nende juurde, peksis Meat Boy ja Bandage Girli labidaga teadvusetuks ning röövis Nuggeti! Kui meie kangelased kohale jõudsid ja avastasid, et Nugget on kadunud, teadsid nad, kelle järele minna. Nad lõid sõrmenukkidest lõhki ja otsustasid mitte kunagi peatuda, kuni nad Nuggeti tagasi saavad ja dr Fetusele väga olulise õppetunni andsid. Õppetund, mida saab anda ainult löökide ja jalahoopidega.
