Samus istorija tęsiasi po Metroid Fusion žaidimo įvykių, kai ji nusileidžia į planetą ZDR ištirti paslaptingo perdavimo, išsiųsto į Galaktikos federaciją. Nuošalią planetą užvaldė žiaurios ateivių gyvybės formos ir šiurpinančios mechaninės grėsmės. Samus yra judresnis ir pajėgesnis nei bet kada anksčiau, bet ar ji gali įveikti nežmonišką grėsmę, persekiojančią ZDR gelmes? Susidurkite su nenumaldomais EMMI robotais – kadaise DNR išskyrimo tyrimo mašinos, įspūdingoji EMMI dabar medžioja Samusą. Įtampa kyla, kai vengiate šių EMMI, kad išvengtumėte žiaurios mirties ir ieškotumėte būdų, kaip juos panaikinti. Sužinokite, kas šiuos robotų stebuklus pavertė ZDR rykšte, ir pabėkite savo gyvybe. Pajuskite, kaip Samuso galia auga, kai įgyjate manevrų ir įgyjate gebėjimų – įgykite naujų ir pažįstamų gebėjimų, kai keliaujate po daugybę šio pavojingo pasaulio aplinkų. Parkuruokite per kliūtis, slyskite per siauras erdves, kovokite su priešais ir kovokite per planetą. Grįžkite į sritis ir pasinaudokite naujais sugebėjimais, kad surastumėte atnaujinimus, alternatyvius kelius ir kelią į priekį. Naršykite besidriekiantį žemėlapį, išvengkite ir sunaikinkite EMMI robotus ir įveikkite baimę, kamuojančią ZDR.
